banner
Centro de Noticias
Nos esforzamos por ampliar constantemente nuestra oferta de productos para satisfacer las necesidades de los clientes en todo el mundo.

crio

Jun 08, 2024

Nature Plants volumen 9, páginas 1359–1369 (2023)Cite este artículo

853 Accesos

6 altmétrico

Detalles de métricas

El corazón de la fotosíntesis oxigénica es el fotosistema II de división del agua (PSII), que forma supercomplejos con una cantidad variable de complejos captadores de luz triméricos periféricos (LHCII). Nuestro conocimiento de la estructura del supercomplejo PSII de plantas verdes se basa en hallazgos obtenidos de varios representantes de algas verdes y plantas con flores; sin embargo, actualmente faltan datos de una planta sin flores. Aquí presentamos una estructura de microscopía crioelectrónica del supercomplejo PSII de abeto, un representante de las plantas terrestres sin flores, con una resolución de 2,8 Å. En comparación con las plantas con flores, el supercomplejo PSII en el abeto contiene una subunidad Ycf12 adicional, la proteína Lhcb4 se reemplaza por Lhcb8 y el LHCII trimérico está presente como un homotrímero de Lhcb1. Inesperadamente, hemos encontrado α-tocoferol (α-Toc)/α-tocoferolquinona (α-TQ) en el límite entre el trímero LHCII y la antena interna CP43. La molécula de α-Toc/α-TQ se encuentra cerca de la clorofila a614 de una de las proteínas Lhcb1 y su cabeza de cromanol/quinona está expuesta a la luz del tilacoide. La posición de α-Toc en el supercomplejo PSII lo convierte en un candidato ideal para el sensor de luz excesiva, ya que α-Toc puede oxidarse a α-TQ mediante oxígeno singlete inducido por alta luz a un pH lumenal bajo. La molécula de α-TQ parece desplazarse ligeramente hacia el supercomplejo de PSII, lo que podría desencadenar importantes modificaciones estructurales y funcionales en el supercomplejo de PSII. La inspección de los mapas de microscopía crioelectrónica de supercomplejos de PSII publicados anteriormente indica que α-Toc/α-TQ puede estar presente en el mismo sitio también en supercomplejos de PSII de plantas con flores, pero su identificación en estudios previos se ha visto obstaculizada por una resolución insuficiente. .

Esta es una vista previa del contenido de la suscripción, acceda a través de su institución

Acceda a Nature y a otras 54 revistas de Nature Portfolio

Obtenga Nature+, nuestra suscripción de acceso en línea con la mejor relación calidad-precio

$29.99 / 30 días

cancelar en cualquier momento

Suscríbete a esta revista

Reciba 12 números digitales y acceso en línea a artículos

$119.00 por año

sólo $9.92 por número

Alquila o compra este artículo

Los precios varían según el tipo de artículo.

desde $ 1,95

a$39.95

Los precios pueden estar sujetos a impuestos locales que se calculan durante el pago.

Los datos proteómicos de espectrometría de masas se depositaron en el Consorcio ProteomeXchange a través del repositorio de socios PRIDE con el identificador PXD035272. El mapa crio-EM del supercomplejo PSII de abeto se ha depositado en el Banco de datos de microscopía electrónica con el código de acceso EMD-16389. El modelo de estructura correspondiente se ha depositado en el APP con el código 8C29.

Shen, L. y col. Estructura de un supercomplejo PSII-LHCII de tipo C2S2M2N2 del alga verde Chlamydomonas reinhardtii. Proc. Acad. Nacional. Ciencia. Estados Unidos 116, 21246–21255 (2019).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Sheng, X. y col. Conocimiento estructural de la captación de luz para el fotosistema II en algas verdes. Nat. Plantas 5, 1320-1330 (2019).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Wei, X. y col. Estructura del supercomplejo del fotosistema II-LHCII de espinacas con una resolución de 3,2 Å. Naturaleza 534, 69–74 (2016).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

van Bezouwen, LS et al. Organización de subunidades y clorofila del supercomplejo del fotosistema II de plantas. Nat. Plantas 3, 17080 (2017).

Artículo PubMed Google Scholar

Su, X. et al. Estructura y mecanismo de ensamblaje del supercomplejo PSII-LHCII tipo C2S2M2 de la planta. Ciencia 357, 815–820 (2017).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Kamiya, N. y Shen, J.-R. Estructura cristalina del fotosistema II que desprende oxígeno de Thermosynechococcus vulcanus con una resolución de 3,7 Å. Proc. Acad. Nacional. Ciencia. Estados Unidos 100, 98-103 (2003).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Ferreira, KN, Iverson, TM, Maghlaoui, K., Barber, J. & Iwata, S. Arquitectura del centro fotosintético de evolución de oxígeno. Ciencia 303, 1831–1838 (2004).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Loll, B., Kern, J., Saenger, W., Zouni, A. y Biesiadka, J. Hacia una disposición completa de cofactores en la estructura de resolución de 3,0 Å del fotosistema II. Naturaleza 438, 1040-1044 (2005).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Minagawa, J. & Takahashi, Y. Estructura, función y ensamblaje del fotosistema II y sus proteínas captadoras de luz. Fotosíntesis. Res. 82, 241–263 (2004).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Jansson, S. Las proteínas de unión a clorofila a / b que captan la luz. Biochim. Biofísica. Acta 1184, 1-19 (1994).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Kouřil, R., Nosek, L., Semchonok, D., Boekema, EJ & Ilík, P. Organización de los supercomplejos del fotosistema II y del fotosistema I de plantas. Subcélula. Bioquímica. 87, 259–286 (2018).

Artículo PubMed Google Scholar

Cao, P., Pan, X., Su, X., Liu, Z. y Li, M. Montaje del fotosistema eucariótico II con diversas antenas captadoras de luz. actual. Opinión. Estructura. Biol. 63, 49–57 (2020).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Croce, R. y van Amerongen, H. Captación de luz en la fotosíntesis oxigenada: la biología estructural se encuentra con la espectroscopia. Ciencia 369, eaay2058 (2020).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Kouřil, R., Nosek, L., Bartoš, J., Boekema, EJ & Ilík, P. Pérdida evolutiva de las proteínas captadoras de luz Lhcb6 y Lhcb3 en los principales grupos de plantas terrestres: ruptura del dogma actual. N. fitol. 210, 808–814 (2016).

Artículo de Google Scholar

Kouřil, R. et al. Organización única de supercomplejos y megacomplejos del fotosistema II en abeto rojo. Planta J. 104, 215–225 (2020).

Artículo PubMed PubMed Central Google Scholar

Grebe, S. y col. El aparato fotosintético único de Pinaceae: análisis de complejos fotosintéticos en Picea abies. J. Exp. Bot. 70, 3211–3225 (2019).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Klimmek, F., Sjödin, A., Noutsos, C., Leister, D. y Jansson, S. Los genes de la proteína Lhc expresados ​​de forma abundante y rara vez exhiben distintos patrones de regulación en las plantas. Fisiol vegetal. 140, 793–804 (2006).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Albanese, P. y col. Reorganización dinámica de supercomplejos del fotosistema II en respuesta a variaciones en las intensidades de la luz. Biochim. Biofísica. Acta Bioenergía. 1857, 1651-1660 (2016).

Artículo CAS Google Scholar

Grinzato, A. et al. Luz alta versus poca luz: efectos sobre el reordenamiento estructural supercomplejo del fotosistema II emparejado en plantas de guisantes. En t. J. Mol. Ciencia. 21, 8643 (2020).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Kashino, Y. et al. Ycf12 es una subunidad central del complejo del fotosistema II. Biochim. Biofísica. Actas 1767, 1269-1275 (2007).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Crepin, A. & Caffarri, S. Funciones y evolución de las isoformas de Lhcb que componen LHCII, el principal complejo captador de luz del fotosistema II de organismos eucariotas verdes. actual. Pépt. de proteínas. Ciencia. 19, 699–713 (2018).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Guardini, Z., Gomez, RL, Caferri, R., Dall'Osto, L. & Bassi, R. La pérdida de una sola clorofila en CP29 desencadena la reorganización del conjunto supramolecular del fotosistema II. Biochim. Biofísica. Acta Bioenergía. 1863, 148555 (2022).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Kruk, J. & Srzałka, K. Presencia y función de la alfa-tocoferol quinona en plantas. J. Fisiol vegetal. 145, 405–409 (1995).

Artículo CAS Google Scholar

Kumar, A., Prasad, A. & Pospíšil, P. Formación de hidroperóxido de α-tocoferol y radical α-tocoferoxilo: relevancia para el estrés fotooxidativo en Arabidopsis. Ciencia. Rep. 10, 19646 (2020).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Graça, AT, Hall, M., Persson, K. & Schröder, WP El modelo de alta resolución del fotosistema II de Arabidopsis revela las consecuencias estructurales de la extracción de digitonina. Ciencia. Rep. 11, 15534 (2021).

Artículo PubMed PubMed Central Google Scholar

Triantaphylides, C. & Havaux, M. Oxígeno singlete en plantas: producción, desintoxicación y señalización. Tendencias de ciencia vegetal. 14, 219–228 (2009).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Krieger-Liszkay, A. & Trebst, A. El tocoferol es el eliminador del oxígeno singlete producido por los estados tripletes de la clorofila en el centro de reacción del PSII. J. Exp. Bot. 57, 1677–1684 (2006).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Shi, LX, Lorkovic, ZJ, Oelmuller, R. & Schroder, WP La proteína PsbW de baja masa molecular participa en la estabilización del complejo del fotosistema II dimérico en Arabidopsis thaliana. J. Biol. Química. 275, 37945–37950 (2000).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Granvogl, B., Zoryan, M., Plöscher, M. y Eichacker, LA Localización de 13 proteínas de membrana integrales de una hélice en subcomplejos del fotosistema II. Anal. Bioquímica. 383, 279–288 (2008).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Kruk, J., Schmid, GH y Strzałka, K. Interacción de α-tocoferol quinona, α-tocoferol y otros prenillípidos con el fotosistema II. Fisiol vegetal. Bioquímica. 38, 271–277 (2000).

Artículo CAS Google Scholar

Bielczynski, LW, Xu, P. & Croce, R. No es necesario el desmontaje supercomplejo de PSII para la inducción de extinción de energía (qE). Fotosíntesis. Res. 152, 275–281 (2022).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Novoderezhkin, V., Marin, A. y van Grondelle, R. Transferencias intra e intermonoméricas en el complejo LHCII de captación de luz: la imagen de Redfield-Förster. Física. Química. Química. Física. 13, 17093–17103 (2011).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Papadatos, S., Charalambous, AC y Daskalakis, V. Una vía para la extinción protectora en proteínas antena del fotosistema II. Ciencia. Reps. Rev. 7, 2523 (2017).

Artículo PubMed PubMed Central Google Scholar

Hakala-Yatkin, M. et al. El campo magnético protege a las plantas de la luz intensa al ralentizar la producción de oxígeno singlete. Fisiol. Planta. 42, 26-34 (2011).

Artículo de Google Scholar

Niewiadomska, E. et al. La falta de tocoferoles influye en la antena PSII y en el funcionamiento de los fotosistemas en condiciones de poca luz. J. Fisiol vegetal. 223, 57–64 (2018).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Dau, H. y col. Consecuencias estructurales de la unión del amoníaco al centro de manganeso del complejo fotosintético que genera oxígeno: un estudio de espectroscopía de absorción de rayos X de partículas isotrópicas y orientadas del fotosistema II. Bioquímica 34, 5274–5287 (1995).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Lichtenthaler, HK Clorofilas y carotenoides: pigmentos de biomembranas fotosintéticas. Métodos Enzimol. 148, 350–382 (1987).

Artículo CAS Google Scholar

Caffari, S., Kouril, R., Kereiche, S., Boekema, EJ y Croce, R. Arquitectura funcional de supercomplejos del fotosistema II de plantas superiores. EDUCACIÓN J. 28, 3052–3063 (2009).

Artículo de Google Scholar

Sorzano, COS et al. Un nuevo algoritmo para la reconstrucción de alta resolución de partículas individuales mediante microscopía electrónica. J. Estructura. Biol. 204, 329–337 (2018).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Zheng, AQ y cols. MotionCor2: corrección anisotrópica del movimiento inducido por el haz para mejorar la microscopía crioelectrónica. Nat. Métodos 4, 331–332 (2017).

Artículo de Google Scholar

Zhang, K. Gctf: determinación y corrección de CTF en tiempo real. J. Estructura. Biol. 193, 1-12 (2016).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

de la Rosa Tevín, JM et al. Xmipp 3.0: un paquete de software mejorado para el procesamiento de imágenes en microscopía electrónica. J. Estructura. Biol. 184, 321–328 (2013).

Artículo de Google Scholar

Punjani, A., Rubinstein, JL, Fleet, DJ y Brubaker, MA cryoSPARC: algoritmos para la determinación rápida de la estructura crio-EM sin supervisión. Nat. Métodos 14, 290–296 (2017).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Scheres, SH RELION: implementación de un enfoque bayesiano para la determinación de la estructura crio-EM. J. Estructura. Biol. 180, 519–530 (2012).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Pettersen, EF y cols. UCSF Chimera: un sistema de visualización para investigación y análisis exploratorios. J. Computación. Química. 25, 1605-1612 (2004).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

DeLano, WL El sistema de gráficos moleculares PyMOL (DeLano Scientific, 2002).

Winn, MD y cols. Descripción general de la suite CCP4 y desarrollos actuales. Acta Crystallogr. D 67, 235-242 (2011).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Krissinel, E. y Henrick, K. Emparejamiento de estructura secundaria (SSM), una nueva herramienta para el alineamiento rápido de la estructura de proteínas en tres dimensiones. Acta Crystallogr. D 60, 2256–2268 (2004).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Krissinel, E. y Henrick, K. Inferencia de conjuntos macromoleculares a partir del estado cristalino. J. Mol. Biol. 372, 774–797 (2007).

Artículo CAS PubMed Google Scholar

Wiśniewski, JR, Zougman, A., Nagaraj, N. & Mann, M. Método universal de preparación de muestras para análisis de proteoma. Nat. Métodos 6, 359–362 (2009).

Artículo PubMed Google Scholar

Descargar referencias

Este trabajo fue apoyado por la Agencia de Subvenciones de la República Checa (proyecto nº 21-05497S para MO, PI, PP, II y RK) y el proyecto del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) 'Las plantas como herramienta para el desarrollo global sostenible' (nº CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000827 a MO, PI, PP, RK, S.Ć.Z. y PT). Agradecemos el apoyo del Ministerio Federal de Educación e Investigación (BMBF, programa ZIK) (subvenciones n.º 03Z22HN23, 03Z22HI2 y 03COV04 a PLK), el proyecto 'hot4cryo' de la Cátedra ERA de Horizonte Europa número 101086665 a PLK, los Fondos Europeos de Desarrollo Regional para Sajonia -Anhalt (subvención nº EFRE: ZS/2016/04/78115 a PLK), financiación de la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) (número de proyecto 391498659 y RTG 2467 a PLK) y la Universidad Martín Lutero de Halle-Wittenberg. Este trabajo también fue financiado por el proyecto no. RO0423 a S.Ć.Z. y PT (Sistemas y tecnologías sostenibles, mejora de la producción de cultivos para una mayor calidad de la producción de alimentos, piensos y materias primas, en condiciones de cambio climático), financiado por el Ministerio de Agricultura de Chequia. CIISB, Centro Instruct-CZ del consorcio Instruct-ERIC EU, financiado por el proyecto de infraestructura MEYS CR LM2023042 y el Fondo Europeo de Desarrollo Regional-Proyecto 'UP CIISB' (no. CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_046/0015974), es Se agradece el apoyo financiero para las mediciones en el Centro Central de Proteómica de CEITEC. Agradecemos a L. Hloušková y J. Bartoš por su ayuda con el cálculo de la tasa FRET. Este artículo está dedicado al profesor emérito Jan Nauš por su destacada contribución al desarrollo de la biofísica en la Universidad Palacký.

Estos autores contribuyeron igualmente: Monika Opatíková, Dmitry A. Semchonok.

Departamento de Biofísica, Facultad de Ciencias, Universidad Palacký, Olomouc, República Checa

Monika Opátíková, Petr Ilík, Pavel Pospíšil y Roman Kouřil

Centro de investigación interdisciplinario HALOmem, Centro de proteínas Charles Tanford, Universidad Martin Luther Halle-Wittenberg, Halle/Saale, Alemania

Dmitry A. Semchonok, Fotis L. Kyrilis, Farzad Hamdi y Panagiotis L. Kastritis

Departamento de Biología Experimental, Facultad de Ciencias, Universidad Palacký, Olomouc, República Checa

David Kopečný

Instituto de Botánica Experimental de la Academia Checa de Ciencias, Centro de Genómica Estructural y Funcional de Plantas, Olomouc, República Checa

Iva Ilíková

Instituto Centroeuropeo de Tecnología, Universidad Masaryk, Brno, República Checa

Pavel Roudnický

Instituto Checo de Investigación y Tecnología Avanzada, Universidad Palacký, Olomouc, República Checa

Sanja Ćavar Zeljković y Petr Tarkowski

Centro de la Región Haná para la Investigación Biotecnológica y Agrícola, Departamento de Recursos Genéticos para Hortalizas, Plantas Medicinales y Especiales, Instituto de Investigación de Cultivos, Olomouc, República Checa

Sanja Ćavar Zeljković y Petr Tarkowski

Instituto de Bioquímica y Biotecnología, Universidad Martin Luther Halle-Wittenberg, Halle/Saale, Alemania

Panagiotis L. Kastritis

Instituto de Biología Química, Fundación Nacional de Investigación Hallénica, Atenas, Grecia

Panagiotis L. Kastritis

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

También puedes buscar este autor en PubMed Google Scholar.

MO, DK, PI, PP, PLK y RK, diseño del estudio. MO, DAS, FLK y FH, preparación de muestras para crio-EM. DAS, análisis de imágenes de datos crio-EM. DK y RK, construcción de maquetas. MO y II, análisis de secuencia de aminoácidos. PR, análisis de espectrometría de masas. PT y S.Ć.Z., composición de ácidos grasos. PT y S.Ć.Z., análisis de α-tocoferol(quinona). MO, DK, PI, PPII y RK, interpretación de datos. MO, DAS, PI, II y RK escribieron el cuerpo principal del artículo y todos los autores lo revisaron y aprobaron.

Correspondencia a Roman Kouřil.

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Nature Plants agradece a Jian-Ren Shen y a los demás revisores anónimos por su contribución a la revisión por pares de este trabajo.

Nota del editor Springer Nature se mantiene neutral con respecto a reclamos jurisdiccionales en mapas publicados y afiliaciones institucionales.

Una descripción del análisis de MS y figuras complementarias. 1–14, Tablas 1–6 y Referencias.

Springer Nature o su licenciante (por ejemplo, una sociedad u otro socio) posee los derechos exclusivos de este artículo en virtud de un acuerdo de publicación con los autores u otros titulares de derechos; El autoarchivo por parte del autor de la versión manuscrita aceptada de este artículo se rige únicamente por los términos de dicho acuerdo de publicación y la ley aplicable.

Reimpresiones y permisos

Opatíková, M., Semchonok, DA, Kopečný, D. et al. Estructura crio-EM de un supercomplejo del fotosistema II de una planta con la proteína captadora de luz Lhcb8 y α-tocoferol. Nat. Plantas 9, 1359-1369 (2023). https://doi.org/10.1038/s41477-023-01483-0

Descargar cita

Recibido: 06 de enero de 2023

Aceptado: 04 de julio de 2023

Publicado: 07 de agosto de 2023

Fecha de emisión: agosto de 2023

DOI: https://doi.org/10.1038/s41477-023-01483-0

Cualquier persona con la que compartas el siguiente enlace podrá leer este contenido:

Lo sentimos, actualmente no hay un enlace para compartir disponible para este artículo.

Proporcionado por la iniciativa de intercambio de contenidos Springer Nature SharedIt